Wierni parafii międzyrzeckich w sposób szczególny przygotowywali się do obchodów Tysiąclecia Śmierci Pierwszych Męczenników Polski, zwanych też Braćmi Międzyrzeckimi. W dniach 12-14 czerwca w kościele pw. św. Jana Chrzciciela, pw. św. Wojciecha i pw. Pierwszych Męczenników Polski gromadzili się wierni na popołudniowych nabożeństwach o Pierwszych Męczennikach Polski. Modlono się, aby Bracia Męczennicy przez śmierć, jaką ponieśli za wierność sumieniu, za wierność Chrystusowi, znaleźli odpowiedź w sercach wierzących, aby świadectwo męczeńskiej śmierci umocniło słabych i małodusznych, stając się posiewem nowej żywotności Kościoła na ziemi międzyrzeckiej i piastowskiej.
Ostatniego dnia triduum, 14 czerwca, w wigilię milenijnych uroczystości we wszystkich międzyrzeckich kościołach trwały czuwania modlitewne. W kościele pw. św. Jana Chrzciciela, w którym od 1966 r. oddawana jest cześć Męczennikom w znaku relikwii, zgromadzili się członkowie parafialnych grup Odnowy w Duchu Świętym. W modlitwie przebłagalnej animowanej przez wspólnotę "Magnificat" prosili Boga: "Panie Jezus Chryste, Synu Boga, zmiłuj się nad nami za to, że tak daleko jesteśmy od podejmowania trudu i cierpienia, czego przykład dali nam Bracia Międzyrzeccy; za opieszałość w budowaniu kościoła wdzięczności; za to, że nasze grzechy przesłaniają nam obfitość Twej miłości".
W kościele pw. św. Wojciecha zgromadzili się czciciele Różańca Świętego. Modlitwą różańcową otoczyli oni szczególnie mieszkańców Międzyrzecza, którzy trwałą czcią otaczają Świętych Męczenników Benedykta, Jana, Mateusza, Izaaka i Krystyna. Potwierdzeniem żywotności tego kultu jest dekret Kongregacji ds. Kultu Bożego i Dyscypliny Sakramentów ustanawiający Pierwszych Męczenników Polski patronami Międzyrzecza. Członkowie Róż Żywego Różańca modlili się także za kapłanów oraz o liczne i święte powołania do życia kapłańskiego i zakonnego.
W budującym się sanktuarium Pierwszych Męczenników zgromadziła się przede wszystkim młodzież oazowa. Czuwanie rozpoczął koncert zespołu Seminarium Duchownego Księży Pallotynów z Ołtarzewa, który zapraszał wszystkich do wychwalania Boga wspólnym śpiewem i tańcem. Następnie wystąpił zespół "Gospel Joy", a wspólne czuwanie modlitewno-muzyczne zakończono Eucharystią o godz. 24.00.