Droga do ogłoszenia patronatu była długa. Pomysł ten zrodził się na progu nowego tysiąclecia. Od tego czasu było wiele inicjatyw związanych z osobą św. Franciszka z Asyżu. Z okazji jubileuszu 50-lecia swojego istnienia chór parafialny otrzymał imię św. Klary, założycielki II Zakonu Franciszkańskiego. Już w 2004 r. dzięki zaangażowaniu bp. Mariana Błażeja Kryszyłowicza do Pełczyc zostały sprowadzone relikwie św. Franciszka, których intronizacja w kościele pełczyckim miała miejsce 19 października 2004 r. Tego roku również społeczność gminna ufundowała do kościoła witraż św. Franciszka.