Bp Ryś przypomniał na początku homilii jak w czasie pielgrzymki Jana Pawła II do Polski w 1997 r. mógł mu towarzyszyć podczas jego odpoczynku w Zakopanem. Opisał jak bardzo zmęczony wrócił wtedy Ojciec Święty z Częstochowy i jak wszyscy tam obecni przygotowali się, by być przed nim rano w kaplicy.

"Pomimo naszych starań on był jednak na Eucharystii przed nami. Mimo, że wieczorem był prawie nieprzytomny ze zmęczenia. Modlitwa była rzeczywiście kluczem do jego posługiwania i to takim, który trzeba rozumieć fizycznie. On się na modlitwie odradzał do życia - odpoczywał i nabierał z powrotem sił" - mówił.

Biskup dodał, że modlitwę Jana Pawła II cechowała niezwykła prostota - że była podobna do modlitwy celnika z odczytanej Ewangelii. "Jak wspomina kard. Dziwisz papież często modlił się przed Najświętszym Sakramentem i nucił pod nosem pieśni religijne. Jednocześnie mieliśmy wrażenie, że im był starszy, tym prościej się modlił i w ten sposób kierował nasze myśli na prostotę modlitwy" - wskazywał bp Ryś.

Zwrócił też uwagę, że człowiek modlący się przed Bogiem jest żebrakiem, który chce wziąć od Boga wszystko, co On daje - i że wymaga to niezwykłej pokory. "A co jeśli Bóg nam daje takie dary, które nam się wydają za proste. Na przykład różaniec. Masz tyle pokory, żeby przyjąć tą modlitwę i dać się Bogu nią nakarmić?" - pytał zebranych.

Na przykładzie ewangelicznego celnika bp Ryś podkreślił także, że modlitwa powinna uświadamiać człowiekowi grzeszność. "Ten celnik bije się w piersi. To jest bardzo ważny gest - on pokazuje Bogu, że chcemy, aby skruszył nam serce. Bo jeśli tego nie będziemy robić to słowa, które wypowiadamy nie wejdą do serca. I to będzie paplanina, a nie żadna modlitwa" - stwierdził.

Zwrócił także uwagę, że Jan Paweł II pokazywał taką postawę poprzez niesamowite akty pokuty, przepraszając Boga za grzechy w imieniu całego Kościoła. "To miłość jest źródłem modlitwy. Modlitwa to jest miłość grzesznika do Boga" - dopowiedział.

"Przyjmijmy tę Jezusową katechezę modlitwy, która jest też wcielona w osobę, dzieło i świętość Jana Pawła II. Daj nam Panie taką modlitwę" - powiedział na zakończenie bp Ryś.

Sanktuarium św. Jana Pawła II jest najważniejszym elementem Centrum św. Jana Pawła II "Nie lękajcie się", które położone jest w sąsiedztwie Łagiewnik, na obszarze dawnych Zakładów Sodowych Solvay, w których pracował młody Karol Wojtyła.

Kamień węgielny pod przyszłą budowę pobłogosławił papież Benedykt XVI podczas spotkania z młodzieżą na Błoniach 27 maja 2006 roku w czasie pielgrzymki do Polski. Uroczystość jego wmurowania w ścianę kościoła odbyła się 23 października 2010 roku.

Sanktuarium zostało erygowane 11 czerwca 2011 roku. W tym dniu miało miejsce uroczyste wprowadzenie relikwii bł. Jana Pawła II do kościoła dolnego.

Na terenie Centrum, które jest wotum dziękczynne Polaków i ludzi z całego świata, oprócz sanktuarium znajduje się Muzeum Jana Pawła II, centrum konferencyjne, dom pielgrzyma oraz centrum rekolekcyjne i rehabilitacyjne.

Przy centrum działa także Instytut Dialogu Międzykulturowego im. Jana Pawła II.