Siostry Franciszkanki Rodziny Maryi na trwałe wpisały się w dzieje tego terenu. Dziś prowadzą Zakład Wychowawczy dla dzieci z opóźnieniem rozwojowym i z rodzin trudnych, noszący imię ich założyciela bł. abp. Zygmunta Szczęsnego Felińskiego, a także Zespół Szkół Specjalnych (szkoła podstawowa, szkoła życia, gimnazjum).
Starsi mieszkańcy pamiętają jeszcze ks. kan. Jana Sapotę, który w latach 1948-1979 był kapelanem sióstr, a w kaplicy zakonnej odprawiał Msze św. dla okolicznych wiernych. W 1958 r. ks. Antoni Konieczny, ówczesny proboszcz parafii św. Izydora w Markach zakupił w pobliżu klasztoru sióstr działkę budowlaną. Księża z Marek dojeżdżali do sióstr z katechizacją. W połowie lat siedemdziesiątych ks. Sapota - poparty przez mieszkańców - zwrócił się do władz o wyrażenie zgody na budowę kaplicy. W 1977 r. zezwolenie nadeszło. Potwierdzało ono stan faktyczny, gdyż niewielka kaplica - wybudowana nielegalnie - już stała. W duszpasterstwie pracowało już wtedy dwóch księży. Kaplicę poświęcił bp Jerzy Modzelewski, a jeszcze w 1977 r. kard. Stefan Wyszyński ustanowił tu prawie-parafię. Pełnoprawna parafia powstała 15 września 1983 r., a erygował ją kard. Józef Glemp, Prymas Polski.
Od początku kaplica była traktowana przez wiernych jako tymczasowa, a marzeniem parafian było posiadanie własnej świątyni. Czasy nie były sprzyjające. Trudno było uzyskać dalsze zezwolenie, ponadto wiele materiałów budowlanych było na przydział. Najpierw - nie bez trudności - została wybudowana plebania. W 1982 r. do parafii przyszedł ks. kan. Stanisław Laskowski. Był już co prawda projekt przyszłej świątyni prof. Władysława Jotkiewicza, ale jego ostateczny kształt został zmieniony i ostateczną dokumentację przygotowali architekci Stępkowski i Zdrojewski. Ks. Laskowski, choć był proboszczem tylko niecałe cztery lata, wybudował kościół, który 1 maja 1985 r. poświęcił kard. Józef Glemp. Następca proboszcza Laskowskiego, ks. kan. Ryszard Okiński kończył wyposażenie wnętrza, stworzył zaplecze świątyni oraz zbudował wieżę dla trzech dzwonów, które ufundowała jedna z parafianek z okazji pielgrzymki Ojca Świętego do Polski i pierwszej wizytacji parafii, której dokonał abp Bronisław Dąbrowski.
Od stycznia 2004 r. proboszczem jest ks. Wojciech Makowski, którego w pracy duszpasterskiej wspomaga wikariusz ks. Paweł Rzępołuch oraz ks. kan. Ryszard Okiński, dawny proboszcz, obecnie rezydent. Nowemu proboszczowi już udało się pomalować ściany wewnątrz świątyni, poprawić nagłośnienie, wzmocnić oświetlenie w prezbiterium. Chętnie podkreśla, że inwestycje wspomogło finansowo Koło Przyjaciół Radia Maryja. To nie jedyna obecność tej grupy w parafii. Codziennie przed Mszą św. wieczorną członkowie Koła razem z Żywym Różańcem prowadzą modlitwę różańcową.
W parafii działają też inne ruchy. Są Rodziny Nazaretańskie, Totus Tuus, Rada Parafialna, asysta, schola, ministranci i bielanki. Asysta i zrzeszeni w Totus Tuus bardzo pomagają podczas dużych uroczystości, np. przygotowując ołtarze w Boże Ciało.
Parafianie lubią pielgrzymować. Organizatorami wyjazdów jest najczęściej Koło Przyjaciół Radia Maryja. Ale pielgrzymują także dzieci pierwszokomunijne. W tym roku wraz z księdzem wikariuszem pojechały do Niepokalanowa.
Kult maryjny w parafii noszącej imię Matki Bożej Królowej Polski jest żywy.
Ksiądz Proboszcz coraz lepiej poznaje swoich parafian. Odbył już pierwszą „kolędę”, w tym roku będzie chodził po raz drugi. Mówi, że ludziom żyje się tutaj biednie. Wiele zakładów pracy upadło. Ci którzy pracują, najczęściej dojeżdżają do stolicy.
Są jednak i radości Proboszcza. Przede wszystkim ta, że spośród uczestników Mszy św. bardzo wiele osób przystępuje do sakramentów świętych. Za najważniejsze uważa świadome uczestnictwo we Mszy św. i dobrą współpracę świeckich z kapłanem. Dlatego często podczas katechez mówi o Mszy św., omawia jej poszczególne części.
Chętnie słucha świeckich. - Ja się na wszystkim nie znam. Dlatego każdy może się wypowiedzieć. Każdego wysłucham, nie boję się krytyki, ale krytykanctwa - podkreśla Ksiądz Proboszcz.

Msze św. w kościele w Markach-Pustelniku
Niedziele: 7.00, 8.00 (u sióstr), 9.00, 10.30, 12.00 i 18.00
W dni powszednie 8.00 i 16.00 (latem 18.00)