Parafia w Terliczce ma krótką, ale już bogatą historię. Ważną datą jest dzień 4 czerwca 1999 r. Wtedy bp Kazimierz Górny nadał tutejszej świątyni drugiego patrona - bł. Ojca Pio, zakonnika kapucyńskiego, beatyfikowanego 2 maja 1999 r. W tej wielkiej uroczystości Kościoła powszechnego w Rzymie uczestniczyli mieszkańcy Terliczki wraz z proboszczem o. Janem Sochockim. W przeddzień beatyfikacji otrzymali w Kurii Generalnej Zakonu Kapucynów od postulatora o. Polina Rossiego relikwie bł. Ojca Pio. Uroczyste wprowadzenie relikwii odbyło 13 czerwca 1999 r. Ceremonii przewodniczył ks. inf. Ireneusz Skubiś, fundator relikwiarza. Od tamtej pory kościół dolny stał się podkarpackim centrum kultu Błogosławionego, zwanym kaplicą Ojca Pio.
W dniu odpustu ku czci bł. Ojca Pio, 23 września 2000 r. bp Edward Białogłowski poświęcił kościół dolny, prezbiterium, ołtarz, replikę krzyża z San Giovanni Rotondo, przed którym Ojciec Pio otrzymał stygmaty oraz obraz i pomnik Błogosławionego.
Kult Ojca Pio rozwijał się bardzo szybko. Po beatyfikacji Terliczka stała się miejscem pielgrzymek i spotkań modlitewnych. Przyjeżdżają tu wierni z okolicznych parafii oraz z odległych miejsc: Mielca, Przemyśla, Przeworska, Sandomierza, Stalowej Woli, Jasła, Łańcuta, Rzeszowa. Wiele osób łączy kult Patronki parafii - Matki Bożej Fatimskiej z uczestnictwem w grupach modlitwy Ojca Pio. Rozpowszechniają kult kolejne wizyty Radia Maryja i Telewizji Trwam. Proboszcz parafii w Terliczce o. Jan Sochocki mówi, że krokami pielgrzymów kieruje tu już teraz sam św. Ojciec Pio.
W 88. rocznicę Objawień fatimskich, w 24. rocznicę ocalenia życia Jana Pawła II i w dniu, kiedy Ojciec Święty Benedykt XVI ogłosił rozpoczęcie procesu beatyfikacyjnego sługi Bożego Jana Pawła II, kościół w Terliczce został podniesiony do godności sanktuarium. Uroczystą Mszę św. koncelebrował bp Edward Frankowski, konsekrator tego kościoła. „Odpowiadając na liczne prośby wiernych, oraz prośbę o. Jana Sochockiego OFM Cap., proboszcza parafii Matki Bożej Fatimskiej w Terliczce z dnia 5 listopada 2004 r., mając na uwadze stale rozwijający się kult, promieniujący na okoliczne parafie, ustanawiam sanktuarium św. Ojca Pio w kościele parafialnym w Terliczce na prawie diecezjalnym - czytamy w dekrecie biskupa rzeszowskiego Kazimierza Górnego. - Opiekę duszpasterską nad sanktuarium powierzam Ojcom Kapucynom. Kustoszem sanktuarium będzie każdorazowo proboszcz tejże parafii. (...) Ufam, iż sanktuarium to będzie promieniować jeszcze bardziej pogłębioną duchowością maryjną oraz posługą ubogim i potrzebującym.”