W homilii ks. Grzegorz Michalczyk, krajowy duszpasterz środowisk twórczych mówił o znaczeniu świątyni wzniesionej przez Jezusa. – Choć nazywamy kościół świątynią, jest on zbudowany zupełnie inną logiką. Nie ma nic wspólnego z pogańskimi miejscami sakralnymi, z tymi „rezerwatami” dla Boga, ale jest przestrzenią, w której gromadzi się lud na modlitwę – podkreślał ks. Michalczyk. Zaznaczył, że świątynia chrześcijańska jest przypomnieniem zupełnie innej świątyni, o której pisał św. Paweł: „Wy jesteście domownikami Boga, zbudowani na fundamencie apostołów”. - Fundamentem jest sam Chrystus, a wy jesteście tymi, którzy rosną na świętą w Panu świątynię. To o tej świątyni mówił Chrystus, że odbuduje ją w przeciągu trzech dni, bo kiedy zmartwychwstał, to Jego ciało było świątynią obecności Boga. Ci, którzy przez chrzest są z Nim złączeni, stają się wraz z Nim świątynią – wyjaśniał krajowy duszpasterz środowisk twórczych.

Ks. Michalczyk poruszył również kwestię tego, jaką funkcję dzisiaj w świecie ma mieć Kościół. - Czy ma być kramem i bazarem, oblężoną twierdzą, albo gościnnym domem dla wszystkich, niezależnie skąd pochodzą? Może nie znaleźli jeszcze Boga, może Go szukają, a może nawet trwają w mroku grzechu, ale Kościół ma być dla nich fascynującym zaproszeniem, a nie odtrąceniem, nie przekleństwem, nie obelgą. Taka jest logika bycia Kościoła dzisiaj w świecie – podkreślał.

Jubileusz był także okazją do podziękowań. - Każdego chciałbym przygarnąć do serca i powiedzieć: dobrze, że tu jesteś. Kościół, który zbudowaliśmy z wielkim trudem teraz jest miejscem skupiającym różne wspólnoty, ale gospodarzami są tu ludzie nauki i kultury. Niech to będzie wskazówka na dzisiaj, na przyszłe lata i na zawsze – powiedział na zakończenie Mszy św. wzruszony ks. Niewęgłowski.

W miejscu obecnego kościoła środowisk twórczych w XVII wieku został wybudowany przez jezuitów kościół Św. Krzyża. W wieku XVIII wzniesiono kościół pw. św. Andrzeja. W czasie Powstania Warszawskiego mieścił się tu szpital powstańczy. W świątyni modlono się do 1953 r., kiedy władze postanowiły rozebrać kościół. W 1999 r. świątynia została odbudowana. Poświęcił ją w czerwcu tego samego roku papież Jan Paweł II podczas wizyty w Warszawie, a konsekrował 25 września 1999 r. kard. Józef Glemp. Od listopada 2003 r. w kościele znajdują się relikwie św. Andrzeja Apostoła.