Leksykon duchowieństwa represjonowanego w Polsce w latach 1945-1989 pod redakcją ks. prof. Jerzego Myszora jest odpowiedzią na apel Ojca Świętego: "W naszym stuleciu wrócili męczennicy (...) trzeba, ażeby Kościoły lokalne (...) uczyniły wszystko dla zachowania pamięci tych, którzy ponieśli męczeństwo" (Jan Paweł II, Tertio millennio adveniente, nr 37).
W pracach nad leksykonem wzięło udział kilkudziesięciu historyków, świeckich i duchownych. Poszczególne biogramy są zbudowane według następującego schematu: podstawowe dane personalne; okoliczności i przyczyny aresztowania; przebieg procesu; współuczestnicy procesu; dane personalne składu sędziowskiego, obrońcy, oskarżyciele; siedziba sądu; paragraf, na podstawie którego sporządzono akt oskarżenia i wydano wyrok; wykonanie wyroku; rehabilitacja.
W opracowywaniu Leksykonu zastosowano tzw. system holenderski. Każdy tom (następne są w planie) stanowi zamkniętą całość ułożoną w porządku alfabetycznym. Pierwszy tom Leksykonu zawiera 274 hasła.