Trzecia pielgrzymka Jana Pawła II do Ojczyzny przypadła w 1987 r., a więc w Roku Maryjnym, obchodzonym w całym Kościele, oraz w czasie Kongresu Eucharystycznego w Polsce. W 1979 r. Papież rozbudził nadzieję na przemiany, które zapoczątkowały solidarną rewolucję pokojową, w 1983 r., pomimo panujących ograniczeń stanu wojennego, nadzieję tę podtrzymał i ugruntował, zaś przez pielgrzymkę w 1987 r. przygotował grunt pod zwycięstwo powiewu Solidarności oraz dał podstawowe wskazania na czasy wyborów, przed którymi w przyszłości Polska miała stanąć.
W 1987 r. Ojciec Święty przybył na Jasną Górę wieczorem 12 czerwca. Podczas Apelu Jasnogórskiego powiedział, że przybywa jako człowiek zawierzenia i przynosi do stóp Pani Jasnogórskiej cały dorobek pielgrzymowania po Polsce, zwłaszcza owoce Kongresu Eucharystycznego - „żeby wszystko tutaj zawierzyć Tej, która jest naszą Matką, Tej, która jest Jasnogórską Panią naszego Narodu i Królową Polski”. W rozważaniu apelowym mówił, że „pielgrzymowanie przez tę polską ziemię nie jest łatwe. Mogłoby się zdawać wręcz niemożliwe - bez wiary. Prowadź nas Twoją wiarą, Maryjo z Nazaretu, Maryjo z Betlejem, Maryjo na Golgocie, Maryjo z Jasnej Góry. Prowadź nas Twoją heroiczną wiarą! Niech nie ustajemy w drodze. Tak jak nie ustają w drodze jasnogórscy pielgrzymi, mimo że czasem są bardzo zmęczeni i nogi mają obolałe”. Jan Paweł II nawiązał do Kongresu Eucharystycznego, podkreślając, że to właśnie Maryja prowadzi nas do Jezusa, który „do końca nas umiłował”. Prosił też Maryję za wszystkich, którzy żyją na polskiej ziemi i zmagają się z trudnościami i własnymi słabościami oraz próbują pomóc innym żyć godniej. Dobitnym głosem wołał z jasnogórskiego Szczytu: „Maryjo, Królowo Polski, Pani Jasnogórska, bądź natchnieniem polskich sumień. Bądź naszą Matką i Wychowawczynią! Nie zrażaj się naszymi słabościami”. Szczególnego znaczenia nabrało tego wieczoru u stóp Jasnej Góry wołanie Namiestnika Chrystusowego, wręcz błaganie, skierowane do Jasnogórskiej Matki i Królowej: „Bądź dla nas wymagająca”. Wybrzmiało ono jako najbardziej autentyczne przyznanie się do bycia uczniem Matki Jezusowej.
W homilii podczas Mszy św. w Kaplicy Cudownego Obrazu Matki Bożej 13 czerwca Jan Paweł II odniósł się do sakramentu Eucharystii i modlił się, by z Jasnej Góry szło to „eucharystyczne wychowanie ludzkiej wolności”, wołając: „Pani Jasnogórska! Nie przestawaj z nami przebywać! Nie przestawaj nam powtarzać tych słów z Kany Galilejskiej: «Cokolwiek wam rzecze, to czyńcie!» Nie przestawaj wskazywać na Twojego Syna”. Nawiązując do jasnogórskiej ewangelizacji wolności, podkreślił, że jedyną zasadą właściwego używania wolności jest miłość. „Człowiek nie może być prawdziwie wolny inaczej, jak tylko przez miłość. Miłość Boga nade wszystko i miłość ludzi - braci, bliźnich, rodaków. Tego właśnie uczy nas Chrystus, który do końca nas umiłował”.
Po Eucharystii w Kaplicy Cudownego Obrazu Jan Paweł II wyszedł do wielkiej rzeszy pielgrzymów zgromadzonych przed Szczytem, aby się z nimi pożegnać. Wówczas to powierzył nam, paulinom, „bezpośrednim stróżom i pierwszym sługom tego świętego miejsca”, oraz wszystkim pielgrzymom troskę o Kościół w całym świecie. „Niech Jasnogórskie Sanktuarium - prosił - dopomoże Papieżowi w trosce o Kościół, o Lud Boży, o wszystkich wierzących tam, gdzie wierzyć i wyznawać wiarę jest najtrudniej. (...) Sanktuarium Jasnogórskie jest jednym z tych miejsc, gdzie przodowanie Ludowi Bożemu ze strony Matki Chrystusa jest szczególnie wyczuwalne”.
Zawierzenie spraw całego Kościoła Jasnogórskiej Matce i Królowej Papież określił jako wotum i swoją gorącą prośbę, którą pozostawił na Jasnej Górze. Jego prośba jest nadal aktualna, może tym bardziej, gdy On już z „okna domu Ojca” patrzy na nas i nam błogosławi - jak mówił podczas Jego pogrzebu obecny Ojciec Święty Benedykt XVI. Zarówno ta prośba Jana Pawła II, jak i wiele innych Jego próśb o pamięć modlitewną, przekładają się na ustawiczną modlitwę za Namiestnika Chrystusowego, która swój szczyt osiąga przede wszystkim w codziennej Eucharystii przed Jasnogórską Ikoną Bogarodzicy o godz. 18.30.