Ceremonia otwarcia Bramy Miłosierdzia rozpoczęła się przed budynkiem, na początku Mszy św., którą odprawia Franciszek. Przed liturgią Słowa odśpiewano litanię do Wszystkich Świętych, w czasie której papież podszedł do środkowych drzwi wejściowych, nad którymi znajduje się mozaika przedstawiająca Chrystusa jako dobrego samarytanina. „Otwórzcie bramy sprawiedliwości” - powiedział Franciszek, po czym pchnął szklane drzwi i stanął pośrodku, by się chwilę pomodlić.

Dalsza część Mszy św. odprawiana jest przy ołtarzu ustawionym w sali stołówki.

Aby nie przeszkadzać setce pensjonariuszy domu, przejście przez Bramę Miłosierdzia będzie możliwe w określonych godzinach, po uprzednim zgłoszeniu tego faktu. Grupy, którym będzie towarzyszył ksiądz, będą mogły odprawić Mszę św. w lokalu stołówki lub w kaplicy hostelu. Wraz z liturgią pobyt w placówce trwał będzie około dwóch godzin.

Wolontariusze będą towarzyszyć pielgrzymom nie tylko w zwiedzaniu domu, a także modlitwie, a następnie w przejściu przez Drzwi Święte. Dla chętnych przewidziano również czterogodzinne „doświadczenie służby” ubogim Rzymu. Wówczas cała wizyta, rozpoczęta o 8.30 lub 14.30, potrwa w sumie sześć godzin.